BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN00629 (UTR included)
(1744 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_690_C1 1669 0.0
BF01026A2B11 811 0.0
>BF14_690_C1
Length = 2438
Score = 1669 bits (842), Expect = 0.0
Identities = 858/862 (99%), Gaps = 1/862 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 462 gcgtacgttcgcacgcttttgacacctctatataacgaaatggtaagagacgttaaagac 521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 983 gcgtacgttcgcacgcttttgacacctctatataacgaaatggtaagagacgttaaagac 1042
Query: 522 gacggagataacagaagaaagagtctgtactcgttgaccaaaaccttcttatgtcaagtt 581
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 1043 gacggagataacagaagaaagagtctgtactcgttgaccaaaacattcttatgtcaagtt 1102
Query: 582 ggcttcaagccttgtattatggaggcccaagagcagttcagtaattggatgcaggcacca 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1103 ggcttcaagccttgtattatggaggcccaagagcagttcagtaattggatgcaggcacca 1162
Query: 642 aatcctgatgaaggaaatcccatttctaatcagtacatctgtccggtattcaaatgggga 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1163 aatcctgatgaaggaaatcccatttctaatcagtacatctgtccggtattcaaatgggga 1222
Query: 702 acgcaaaaggagtgggattttggactacaaagggttataaacttcccaccatcgagaaaa 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1223 acgcaaaaggagtgggattttggactacaaagggttataaacttcccaccatcgagaaaa 1282
Query: 762 caaagcgaaagaacgtatctccttaaaacattagccggttgtccagtggatgagaagaaa 821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1283 caaagcgaaagaacgtatctccttaaaacattagccggttgtccagtggatgagaagaaa 1342
Query: 822 atagagaaattgttaaatataacgattctagaaggcaacggaaactttacggaaacggat 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1343 atagagaaattgttaaatataacgattctagaaggcaacggaaactttacggaaacggat 1402
Query: 882 ttattcttaatattcagtatgctgacgggaaattctcaaggttacacaaccttattctat 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1403 ttattcttaatattcagtatgctgacgggaaattctcaaggttacacaaccttattctat 1462
Query: 942 ttcctcaacaacaattgggacgtgctcaaagaaaaattctcgagtaagacaaatatttgg 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1463 ttcctcaacaacaattgggacgtgctcaaagaaaaattctcgagtaagacaaatatttgg 1522
Query: 1002 gataacatgataacgtccgcgacctcgcagttcacgacgaagcctggtatgaatctggtg 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1523 gataacatgataacgtccgcgacctcgcagttcacgacgaagcctggtatgaatctggtg 1582
Query: 1062 gctataatgtacgacaatcacaaaggcgaattcggttcagccgagcatattatagagaaa 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1583 gctataatgtacgacaatcacaaaggcgaattcggttcagccgagcatattatagagaaa 1642
Query: 1122 tcgctgagaaacattcgcgaggaagctaaatggtcagaagaaaacattcctgtgatagag 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1643 tcgctgagaaacattcgcgaggaagctaaatggtcagaagaaaacattcctgtgatagag 1702
Query: 1182 acatggctagacgactacctctcaagaaccgaggtcaaagacgaccaggcgatcgacgct 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1703 acatggctagacgactacctctcaagaaccgaggtcaaagacgaccaggcgatcgacgct 1762
Query: 1242 taataatatgttaatacagacagattatatatagtgtttatatatgttaatacagacaga 1301
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1763 taataatatgttaatacagacagattatatatagagtttatatatgttaatacagacaga 1822
Query: 1302 -ttatatatagtgtttatatat 1322
|||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1823 tttatatatagagtttatatat 1844
Score = 769 bits (388), Expect = 0.0
Identities = 447/464 (96%), Gaps = 2/464 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1283 atatgttaatacagacagattatatatagtgtttatatatgttaatacagacaaatt-at 1341
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct: 1768 atatgttaatacagacagattatatatagagtttatatatgttaatacagacagatttat 1827
Query: 1342 atatagagtttatatataaagattcgttagtctagatagtattttatttacacccatgtg 1401
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1828 atatagagtttatatataaagattcgtaagtctagatagtattttatttacacccatgtg 1887
Query: 1402 taaattactaagctgaatacatactatttatatgatgtgtgaattaattatatatgtttt 1461
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1888 taaattacaaagctgaatacatactatttatatgatgtgtgaattaattatatatgtttt 1947
Query: 1462 ataaaaaggacatttaatttgtttttattt-aatgtcattatatatcacgaaaaaatgaa 1520
||||||| || ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1948 ataaaaaagatatttaatttgttttttttttaatataattatatatcacgaaaaaatgaa 2007
Query: 1521 cagtatcaaacatttaatcaagtgaacgaactaatggtaattcgaatagtcaaatagtaa 1580
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 2008 cagtatcaaacatttagtcaagtgaacgaactaatagtaactcgaatagtcaaatagtaa 2067
Query: 1581 ttcaaattcatcaataaagttctaaaatttttgaactatgaaaatgaatcaggaagaaac 1640
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2068 ttcaaattcatcaataaatttctaaaatctttgaactatgaaaatgaatcaggaagaaac 2127
Query: 1641 tatggattacctacaataaaatttattaatgattgaactttcttatgaagttagtaaggc 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 2128 tatggattacctacaataaaatttattaatgattgaactttcttatgaagttagtcaggc 2187
Query: 1701 attgaaaaatttacgaaccgttgttatataggcgaatcctcgaa 1744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2188 attgaaaaatttacgaaccgttgttatataggcgaatcctcgaa 2231
>BF01026A2B11
Length = 480
Score = 811 bits (409), Expect = 0.0
Identities = 430/436 (98%), Gaps = 2/436 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1036 cgacgaagcctggtatgaatctggtggctataatgtacgacaatcacaaaggcgaattcg 1095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 11 cgacgaagcctggtatgaatctggtggctataatgtacgacaatcacaaaggcgaattcg 70
Query: 1096 gttcagccgagcatattatagagaaatcgctgagaaacattcgcgaggaagctaaatggt 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 71 gttcagccgagcatattatagagaaatcgctgagaaacattcgcgaggaagctaaatggt 130
Query: 1156 cagaagaaaacattcctgtgatagagacatggctagacgactacctctcaagaaccgagg 1215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 cagaagaaaacattcctgtgatagagacatggctagacgactacctctcaagaaccgagg 190
Query: 1216 tcaaagacgaccaggcgatcgacgcttaataatatgttaatacagacagattatatatag 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 tcaaagacgaccaggcgatcgacgcttaataatatgttaatacagacagattatatatag 250
Query: 1276 tgtttatatatgttaatacagacagattatatatagtgtttatatatgttaatacagaca 1335
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 tatttatatatgttaatacagacagattatatatagtgtttatatatgttaatacagaca 310
Query: 1336 aattatatatagagtttatatataaagattcgttagtctagatagtattttatttacacc 1395
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 gattatatatagagtttatatataaagattcgtaagtctagatagtattttatttacacc 370
Query: 1396 catgtgtaaattactaagctgaatacatactatttatatgatgtgtgaattaattatata 1455
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 371 catgtgtaaattgctaagctgaatacatactatttatatgatgtgtgaattaat--tata 428
Query: 1456 tgttttataaaaagga 1471
||||||||||||||||
Sbjct: 429 tgttttataaaaagga 444
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 272,230
Number of extensions: 5596
Number of successful extensions: 5596
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 5587
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 1744
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 1727
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 14021908483
Effective search space used: 14021908483
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)