BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN05724 (UTR included)
(2473 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1932_C1 2161 0.0
BF01014B2F12 1094 0.0
>BF14_1932_C1
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 362 gaatgtgacttgggtcatactcagtatagtaacaactatcggatcacattttcttttggc 421
Query: 1400 cttcacatttatcaatccgtatgttggagtgatgtccttaggaatttcctattcgctgct 1459
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Query: 1520 atatgggatatctcaagccgtccaaaacatgggtttggccacagttctcattttagctgg 1579
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Sbjct: 542 atatgggatatctcaagccgtccaaaacatgggtttggccacagttctcattttagctgg 601
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Query: 1640 tatctctttgatagctggtgttgttatatatatagtggattcagcgaacaatggtatcct 1699
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Query: 1760 gacagccaatctcctggatcacgtggacagctcggatcaagaggaagttgactcgcgatt 1819
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Query: 1820 gaccaatcaacacagttcccaattgaccaatcagaacgctggaatcgaatcgtccgggga 1879
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Sbjct: 842 gaccaatcaacacagttcccaattgaccaatcagaacgctggaatcgaatcgtccgggga 901
Query: 1880 ttttccgcgggaccctgcgcaggcgcattccgacagaatacgatctagatacatatcgca 1939
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Sbjct: 902 ttttccgcgggaccctgcgcaggcgcattccgacagaatacgatctagatacatatcgca 961
Query: 1940 actactgccctcaaccattccagacagatcctaatcatagatattttgtaaataacttaa 1999
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Sbjct: 962 actactgccctcaaccattccagacagatcctaatcatagatattttgtaaataacttaa 1021
Query: 2000 ataagtataatgtagtttgtattaactttttataattattactattatgacgatataaat 2059
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Sbjct: 1022 ataagtataatgtagtttgtattaactttttataattattactattatgacgatataaat 1081
Query: 2060 tattgattatatgcaataaacgatttgacgttca 2093
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Sbjct: 1082 tattgattatatgcaataaacgatttgacgttca 1115
>BF01014B2F12
Length = 801
Score = 1094 bits (552), Expect = 0.0
Identities = 552/552 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 392 caagatggataatccagaatctagctcttcgacgcgactgaaccaggatccacctacatc 451
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Sbjct: 250 caagatggataatccagaatctagctcttcgacgcgactgaaccaggatccacctacatc 309
Query: 452 ttggtgtcaccctgctcatagggttcacagatttttagctcttattcttatgtgtttcct 511
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Sbjct: 310 ttggtgtcaccctgctcatagggttcacagatttttagctcttattcttatgtgtttcct 369
Query: 512 ttgttttggttcatatttctgttatgatacaccgggtgctctggccgacaacttcaaggg 571
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Sbjct: 370 ttgttttggttcatatttctgttatgatacaccgggtgctctggccgacaacttcaaggg 429
Query: 572 tgactcacatctaaacacatcccagtttgcgctgctctactctatatactcatggcctaa 631
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Sbjct: 430 tgactcacatctaaacacatcccagtttgcgctgctctactctatatactcatggcctaa 489
Query: 632 tgtaatattatgctttattggcggttatctcattgatagatatttcggtgtgagattggg 691
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Sbjct: 490 tgtaatattatgctttattggcggttatctcattgatagatatttcggtgtgagattggg 549
Query: 692 tacaataatttatatgaccatagtgttcattggagcagttgtattcgcttttggtgttta 751
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Sbjct: 550 tacaataatttatatgaccatagtgttcattggagcagttgtattcgcttttggtgttta 609
Query: 752 cattaatcaattttggcttatgatacttggaagatttatatttggtattggaggagagtc 811
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Sbjct: 610 cattaatcaattttggcttatgatacttggaagatttatatttggtattggaggagagtc 669
Query: 812 tttgcaagtagcggttaacaactatgtagttctttggttcaatggaaaggaacttaatat 871
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Sbjct: 670 tttgcaagtagcggttaacaactatgtagttctttggttcaatggaaaggaacttaatat 729
Query: 872 ggtgtttggactccaattgtcgttctcaagatttggaagcactgtgaatttttgggtcat 931
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Sbjct: 730 ggtgtttggactccaattgtcgttctcaagatttggaagcactgtgaatttttgggtcat 789
Query: 932 ggaacctattta 943
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Sbjct: 790 ggaacctattta 801
Score = 456 bits (230), Expect = e-128
Identities = 246/250 (98%), Gaps = 1/250 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 60 ataattgttaattaatatttaaaagatttatcattttgtgatgtgattttgtaatgtaat 119
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Sbjct: 1 ataattgttaatta-tatttaaaagatttataattttgtgatgtgattttgtaatgtaat 59
Query: 120 tcaatatatttttaattgtttgacggtcttaatatacattatattatatagtatgtaata 179
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Sbjct: 60 tcaatatatttttaattgtttgacggtcttaatatacattatattatatagtatgtaata 119
Query: 180 tgtaaaataattttaatgatcagtatgttttttactttattttaaacctactcaatgtgt 239
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Sbjct: 120 tgtaaaataattttaatgatcagtatgttttttactttattttaaacctactcaatgtgt 179
Query: 240 aaagactttcataatatttcttttattttcctacctatgccttaaggtcaactctagatt 299
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Sbjct: 180 aaagactttcataatatttcttttattttcctacctatgccttaaggtcaacgttagatt 239
Query: 300 tttgattgtt 309
||||||||||
Sbjct: 240 tttgattgtt 249
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 353,776
Number of extensions: 9001
Number of successful extensions: 9001
Number of sequences better than 1.0e-10: 2
Number of HSP's gapped: 8998
Number of HSP's successfully gapped: 3
Length of query: 2473
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2456
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 19940826424
Effective search space used: 19940826424
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)