BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN18625 (UTR included)
(3364 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01015A1D11 1267 0.0
BF01038A1E04 793 0.0
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>BF01015A1D11
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Strand = Plus / Plus
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Query: 3238 gtttggtcgcttatatttctaatttgtaattcgtttcagcaacaagatttgagaaatatt 3297
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>BF01038A1E04
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Query: 1749 gaaaaatggtacatgatagaagtcggtaaaagcaatgataattttgtgcaagctggagta 1808
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>BF01044A1D01
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Sbjct: 12 tacatatatatatatatatatatatatatatatata 47
>BF14_906_C1
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Sbjct: 1090 catatatatatatatatatatatatatatatata 1123
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 485,942
Number of extensions: 21474
Number of successful extensions: 21474
Number of sequences better than 1.0e-10: 18
Number of HSP's gapped: 21259
Number of HSP's successfully gapped: 23
Length of query: 3364
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3346
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 27135206770
Effective search space used: 27135206770
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)